клеточные культуры
Набор реагентов prepGEM Universal
Адаптируемый набор реагентов, подходящий для выделения ДНК из биологических образцов
Продукция компании MicroGEM создана, чтобы упростить методы молекулярного анализа.
Ферментативный подход MicroGEM к извлечению нуклеиновых кислот, первому шагу пробоподготовки, позволяет быстро и с минимальным вмешательством подготовить образец для последующего анализа.
Однопробирочные протоколы позволяют выделять и стабилизировать нуклеиновые кислоты в несколько шагов за считанные минуты без использования агрессивных реагентов, что несомненно уменьшает количество возможных ошибок и позволяет оптимизировать временные и денежные затраты.
Среди приоритетов производителя можно выделить следующее:
MicroGEM владеет уникальной коллекцией культур экстремофилов из Новой Зеландии и Антарктиды. Ученые и инженеры компании являются активными сторонниками ферментативных экстракций и технологий температурного контроля.
Компания MicroGEM стремится коренным образом изменить методы исследований в области Life Science, оказывая влияние на такие области как здоровье человека, контроль над урожаем, идентификации человека и окружающей среды.
Большинство методов экстракции нуклеиновых кислот основаны на твердофазной очистке или экстракции путем использования растворителей. В некоторых случаях лизис достигается с использованием ингибирующих агентов, таких как SDS, которые необходимо нейтрализовать или удалить из раствора, прежде чем нуклеиновая кислота будет использована для анализа. Это требование увеличивает количество манипуляций и, если используются твердофазные методы или растворители, снижается выход целевого продукта.
Красивые гейзеры, горячие бассейны и вулканы Новой Зеландии и Антарктиды населены множеством экстремофильных архей, бактерий и грибов, способных выживать при температурах от 0 °C до 100 °C. Имея базу из более чем 1000 микроорганизмов, возможно использовать уникальные свойства микроорганизмов для упрощения рабочих процессов молекулярной биологии.
MicroGEM предлагает однопробирочный метод с использованием контроля температуры реакции, который решает недостатки традиционного способа, позволяя получить максимальный выход продукта за минуты вместо часов.
Уникальность технологии, используемой в наборах от производителя MicroGEM, заключается в термостабильной prepGEM.
prepGEM работает при температурах оптимальных для экстракции нуклеиновых кислот. Активируется при 75 °C и денатурирует при 95 °C.
Сравнение prepGEM и протеиназ K | |
prepGEM | Протеиназа K |
|
|
Существует два типа температурного контроля в зависимости от типа образца.
Одиночный режим
Для одиночного температурного режима — prepGEM — единственный фермент в реакции. Простые изменения температуры активируют фермент, освобождающий одноцепочечную ДНК от белков. Технология использует 2 температурных режима, термофильный фермент деактивируется на первом этапе.
При 75 °C активируется prepGEM, происходит лизис клетки, разрушаются нуклеазы и высвобождается ДНК. При 95 °C prepGEM деградирует.
Мульти-режим
При пониженных температурах мезофильные гидролазы разрушают клеточную стенку.
При 75 °C активируется prepGEM, происходит лизис клетки, разрушаются нуклеазы и высвобождается ДНК. При 95 °C prepGEM деградирует.
Процесс температурно-контролируемой экстракции может подразумевать использование смеси ферментов. Т.к. prepGEM при мезофильных температурах имеет низкую активность, становится возможным использовать мезофильные ферменты для разрушения клеточной стенки. При необходимости возможно подстроить ферментную систему под тип образца. Реакция все также проходит в одной пробирке и может быть адаптирована для работы на термоциклере, используемом в лаборатории.
Технологический потенциал, уникальный фермент и температурнозависимые реакции — всё это MicroGEM используют в своих продуктах.
На данный момент разработан ряд наборов для выделения нуклеиновых кислот, актуальных для использования в таких областях, как научные исследования, фармацевтическое производстве, биотехнологии, сельское хозяйство и медицинские исследования, а также в судебно-криминалистических экспертизах.
Последовательность реакций задается изменением температуры в термоциклере, поэтому экстракция нуклеиновых кислот может проходить в одной пробирке без дополнительных этапов пипетирования.
«Дорожные карты» выделения ДНК различными методиками из 24 образцов.
Наборы реагентов MicroGEM возможно использовать для выделения нуклеиновых кислот из различных образцов, включая ткани, культуры клеток, насекомых, сперму, и другие типы биоматериала, которые используются для ПЦР и STR анализа, полногеномного секвенирования, NGS, геномного редактирования методом CRISPR/Cas9, трансфекции.
В состав наборов входят ферменты, буферы, дополнительные компоненты,необходимые для разрушения клеток. Широкая линейка продуктов позволяет подобрать подходящий набор для своих целей, исходя из типа исследуемого биоматериала.
При работе с культурами клеток необходимо выделять ДНК из большого количества образцов маленького объема. Набор prepGEM Universal - это оптимальное решение для работы с малым количеством клеток и единичными клетками.
клеточные культуры
Адаптируемый набор реагентов, подходящий для выделения ДНК из биологических образцов
При исследовании микробиологических культур важно быстро проводить экстракцию в мягких условиях. Экспресс-подготовка образца, экстракция в одной пробирке и мягкий лизис исключают возможность кросс-контаминации и ДНК фрагментации, а также способствуют сохранению ДНК в случае работы с редкими штаммами.
бактерии
Простой подход к изучению широкого спектра микробных культур
Выделение РНК из биологических образцов обычно затруднено присутствием РНКаз, которые разрушают РНК. Набор prepGЕМ позволяет выделять РНК, работая при этом с культурой клеток или с единичными образцами.
РНК
Простое выделение РНК от одной клетки
до 100 000 клеток
Широко используемый набор реагентов, предназначение которого выделение ДНК из образцов слюны (жидкая, мазок, сухие пятна, табачные окурки), крови (жидкая, мазок, сухие пятна) и тканей (твердые образцы тканей, волос).
Слюна, кровь, ткани
Выделение ДНК из различных образцов слюны, крови, тканей. Подходит для ручного выделения
Наборы forensicGEM Sperm показывают воспроизводимые результаты даже для малого количества образца, что делает их оптимальными для использования в судебно-криминалистической экспертизе. Для лизиса клеток не используются такие реагенты как DTT и SDS, ингибирующие количественную ПЦР и STR.
Семенная жидкость
Экстракция ДНК из образцов семенной жидкости для использования в судебно-криминалистических целях
Вид образца | Характер использования | ||||
Термостат / термоциклер | Время экстрации | Наука | Судмедэкспертиза | ||
prepGEM Universal |
Клеточные культуры Суспензионные и адгезионные клеточные культуры, клетки, отсортированные FACS/LCM |
✔ | 15 мин | ✔ | |
RNAGEM | РНК Клеточные культуры млекопитающих, клетки, отсортированные FACS/LCM |
✔ | 15 мин | ✔ | |
prepGEM Bacteria | Бактерии Грам +/- бактерии, протисты, колонии и жидкие культуры, биопленки, мазки, археи, почва, вода, фекалии |
✔ | 37 мин | ✔ | |
prepGEM Universal |
Ткани Ткани животных, хвосты мышь и крыс, плавники, насекомые и биопсийный материал |
✔ | 25 мин | ✔ | |
forensicGEM Universal |
✔ | 25 мин | ✔ | ||
forensicGEM Sperm |
Сперматозоиды Сперматозоиды, семенная жидкость, сухие пятна, генитальные мазки |
✔ | 20 мин | ✔ | |
prepGEM Universal |
Слюна Жидкая слюна, мазки буккального эпителия, сухие пятна |
✔ | 15 мин | ✔ | |
forensicGEM Universal |
✔ | 15 мин | ✔ | ||
prepGEM Universal |
Кровь Жидкая кровь (свежая, с EDTA, гепарином, цитратом), мазки и сухие пятна |
✔ | 20 мин | ✔ | |
forensicGEM Universal |
✔ | 20 мин | ✔ |