Набор реагентов prepGEM Bacteria для выделения ДНК из бактерий, MicroGEM

Описание набора prepGEM Bacteria:

Набор MicroGEM Bacteria — простой автоматизированный подход к изучению широкого спектра микробных культур. Методика MicroGEM обеспечивает быструю и бережную обработку образцов. Минимальная пробоподготовка, обработка в закрытых пробирках и бережный лизис гарантируют, что перекрестное загрязнение и фрагментация ДНК практически исключены, что упрощает процесс экстракции при сохранении целостности видов с низкой численностью.

Возможности:

• Подходит для экстракции ДНК из бактерий, микробных образцов: грамположительных и грамотрицательных бактерий, простейших, архей. Возможно работать с колониями и жидкими культурами, образцами биопленки и слизистой оболочки, мазками и метагеномной ДНК;
• Одноцепочечная ДНК подходит для ПЦР, количественной ПЦР, целевого секвенирования (секвенирование ампликонов) из метагеномных образцов, секвенирования 16S рДНК

Особенности работы:

• Новый ферментативный лизис, управляемый температурой реакции. Используется термофильная протеиназа в сочетании с мезофильным лизоцимом;
• Быстрый рабочий процесс;
• Легко автоматизируется для высокой производительности;
• Закрытая система - отсутствие перекрестного заражения и защита от патогенов;
• Щадящий лизис без этапов переноса - сохраняет ДНК;
• Минимальное взаимодействие с образцами на всех этапах реакции означает, что ДНК не повреждается и выделяется в максимальной концентрации;
• Легкая адаптация набора к различным типам образцов и рабочим протоколам

Возможные комплектации наборов:

Кол-во реакций	Артикул	Каждый набор включает:
50	PBA0050	prepGEM Lysozyme GREEN+ Buffer Enhancer Wash
100	PBA0100
500	PBA0500
1000	PBA1000

БРОШЮРЫ:

• Quick-Start Guide: prepGEM Bacteria
• Quick-Start Guide: prepGEM Bacteria (Chinese)
• Safety Data Sheet: prepGEM Bacteria

Целевое секвенирование подмножества генов или определенных областей генома может быть эффективным подходом для изучения определенных областей, представляющих интерес для конкретного исследования. Это может сэкономить много времени и денег и уменьшить ненужную сложность. Целевое секвенирование ампликона бактериального гена 16S рРНК, наиболее часто используемого гена в микробной систематике, было особенно полезным для улучшения нашего понимания динамической природы микробных популяций и их воздействия на окружающую среду и здоровье человека. Этот подход упростил изучение бактериального разнообразия в различных средах обитания, что позволило охарактеризовать микробиомы и бактерии, которые было бы трудно изучить с помощью традиционных методов.

Способность обнаруживать бактериальные штаммы, которых мало в микробиомах, может существенно повлиять на интерпретацию микробиологических изменений. Изоляция полной ДНК - ключевой шаг к обеспечению того, чтобы полученный образец был действительно репрезентативным для сообщества в целом, имел высокое качество, высокую чистоту и был максимально объективным. Из-за очевидной неоднородности образца и окружающей среды трудно лизировать клетки всех видов с одинаковой эффективностью.

Традиционные и доступные в настоящее время методы слишком жестки для образца, что может привести к физическому повреждению ДНК. Это особый вопрос, связанный с извлечением ДНК из видов с низкой численностью.

В наборе PrepGEM Bacteria используется новая смесь из мягких буферов, агрессивной термофильной протеиназы MicroGEM (prepGEM) и мезофильного лизоцима для мягкого, но эффективного лизиса клеток как грамположительных, так и отрицательных бактерий из метагеномных образцов. Этот щадящий процесс лизиса без каких-либо этапов переноса гарантирует сохранение целостности видов с низкой численностью.

Бактериальные ампликоны 16SrDNA разного размера, полученные из ДНК, экстрагированной с помощью набора «PrepGEM Bacteria» из чистых культур грамположительных и грамотрицательных бактерий.