Описание набора prepGEM Universal:
PrepGEM Universal — решение от компании MicroGEM для легкого выделения ДНК из крови, слюны, тканей и клеточных культур. Вся экстракция проводится в одной пробирке без промывок или дополнительных операций и без потери ДНК. Весь процесс легко автоматизировать с использованием общелабораторного оборудования (стандартный термоциклер можно запрограммировать для проведения экстракции, в том числе и из одной клетки).
Является отличным инструментом для исследователей, работающих с технологией CRISPR/Cas9.
Возможности prepGEM Universal:
- Подходит для выделения ДНК из крови, слюны, тканей и клеток (в т.ч. животных), например, образцов ушного хряща, хвостов мышей, клеток насекомых;
- В результате выделения получается одноцепочечная ДНК, которая подходит для STR, ПЦР, количественной ПЦР, секвенирования ампликонов;
- Может быть использована при работе с технологией CRISPR/Cas9
Особенности работы:
- Оптимизированный протокол позволяет выделить ДНК примерно за 15 минут;
- Процесс отмывки от ингибитора не нужен;
- Экстракция в закрытой пробирке обеспечивает целостность образца;
- Простота рабочего процесса позволяет сэкономить время, деньги и выход пластика при проведении реакции
Возможные комплектации наборов:
| Кол-во реакций | Артикул | Каждый набор включает: |
| 50 | PUN0050 |
|
| 100 | PUN0100 | |
| 500 | PUN0500 | |
| 1000 | PUN1000 |
Особенности использования наборов prepGEM Universal на образцах тканей:
Традиционно выделение ДНК из клеток органов подразумевает добавление различных химикатов и детергентов для разрушения клеточной мембраны и удаления ингибиторов. Технология компании MicroGEM включает в себя лишь два этапа: быструю подготовку образца и экстракцию в закрытой пробирке.
- Предназначены для научно-исследовательских проектов и судебно-криминалистических экспертиз для выделения ДНК из образцов тканей, насекомых, мышиных хвостов, рыбных плавников, жировых, мышечных и смешанных тканей, волос и тканевых отпечатков;
- Подходят для выделения из твердых тканей без необходимости гомогенизации;
- Благодаря отсутствию потерь ДНК подходят для выделения из образцов малого объема
Особенности использования наборов prepGEM Universal на образцах слюны:
Слюна часто используется в судебно-криминалистических экспертизах, а также в научных исследованиях в области геномики, протеомики и биоинформатики.
- Предназначены для работы с образцами жидкой слюны, мазков и сухих пятен слюны;
- Подходят для экстракции ДНК в кратчайшие сроки;
- Выделенная ДНК имеет качество, необходимое для генетического сравнения двух особей
Особенности использования наборов prepGEM Universal на образцах крови:
Получение достаточного количества качественной ДНК из образцов крови может быть затруднено из-за сложных и многостадийсных методик выделения. Наборы prepGEM Universal позволяют избежать этих сложностей, благодаря простой и быстрой технологии.
- Подходят для образцов жидкой крови, мазков и сухих пятен крови;
- Способствуют получению качественных экстрактов даже из образцов малых объемов без потерь ДНК;
- Упрощают процесс выделения для научно-исследовательских и судебно-криминалистических задач
КЛЕТОЧНЫЕ КУЛЬТУРЫ
Одностадийный лизис и экстракция в закрытых пробирках с контролируемой температурой — надежное решение для выделения ДНК из клеточных культур.
При работе с культурами клеток возникает необходимость выделить ДНК из большого количества образцов в небольших объемах.
При применении технологии редактирования генома CRISPR / Cas9 требуется генотипирование с помощью Next Gene Sequencing (NGS), для подтверждения изменения целевого гена. Эта задача требует работы с очень небольшим количеством клеток. Это трудоемко, дорого и сложно с обычными методами очистки.
Рабочие объемы до субмикролитровых объемов, что позволяет упростить работу с небольшим количеством клеток.
Для извлечения РНК из культивируемых клеток см. RNAGEM.
НАСЕКОМЫЕ
Насекомые поедают от 5 до 20% важнейших зерновых культур, производимых в мире. Кроме того, трансмиссивные болезни, передаваемые насекомыми, составляют более 17% всех инфекционных заболеваний, вызывая ежегодно более 700 000 смертей и миллионы случаев различных заболеваний.
Существует множество причин, по которым важно проводить идентификацию насекомых на уровне вида, например, основные меры борьбы с насекомыми, идентификация карантинных вредителей и различение насекомых-переносчиков болезней. Процесс выделения ДНК зачастую является сложным в том случае, когда исследуемого образца очень мало и им трудно манипулировать, например, если используются конечности насекомых, личинки и / или яйца.
Набор реагентов PrepGEM от MicroGEM обеспечивает быстрое и простое выделение одноцепочечной ДНК в одной пробирке из цельных насекомых и их частей, свежих или замороженных. Методика работы в одной пробирке позволяет извлекать из небольших образцов.
БРОШЮРЫ:
- Quick-Start Guide: prepGEM Universal
- Safety Data Sheet: prepGEM Universal
- App Note: Fast and Simple DNA preparation for the screening of CRISPR/Cas9-generated Knockout Cell Lines
- App Note: Rapid extraction of DNA from limited FFPE material derived from lung tumour of engineered mice
- Technical Overview: Efficient DNA Extractions for CRISPR toolkits – A Simplified CRISPR Genotyping Workflow
ССЫЛКИ НА ПУБЛИКАЦИИ:
Сельское хозяйство
Исследования показывают, что PrepGEM оптимальный выбор для обнаружения организмов-вредителей и характеристики потенциальных агентов биологической борьбы.
- Natural enemies of armored scales (Hemiptera: Diaspididae) and soft scales (Hemiptera: Coccidae) in Chile: Molecular and morphological identification
- Investigating Biological Control Agents for Controlling Invasive Populations of the Mealybug Pseudococcus comstocki in France
- Detection of spotted-wing drosophila, Drosophila suzukii
- Detection of Pacific fruit fly, Bactrocera xanthodes
- Detection of African fig fly, Zaprionus indianus
- Phylogenetic analysis of pest South Pacific sap beetle species
- Characterising Aphelinid wasps as a biological control agent
- Characterising a Nematode species as a biological control agent
- Identification of scale insects on kiwifruit in New Zealand
Насекомые-переносчики болезней
Эти исследования демонстрируют, что экстракты PrepGEM подходят для исследований по выявлению и мониторингу насекомых-переносчиков болезней.
- Identification of clade types of malaria vector mosquito in north-eastern Tanzania
- Monitoring insecticide resistance in malaria vector mosquito in south-east Tanzania
- Understanding the population structure of a species of tsetse fly in Uganda
Лабораторные исследования
Обычно используемым модельным организмом является нематода C. elegans. PrepGEM использовался для изучения популяций C. elegans с акцентом на генетическое разнообразие и воспроизводство.
- Characterising male genotypes of C. elegans in response to a novel environment
- Understanding genotype distribution during the experimental evolution of C. elegans
Аквакультура
PrepGEM использовался в аквакультуре для извлечения ДНК из личинок каменного омара с целью определения видов отобранных организмов. Он также использовался для разработки недорогого метода экстракции ДНК из креветок для генотипирования в программе разведения.
| Вид образца | Характер использования | ||||
| Термостат / термоциклер | Время экстрации | Наука | Судмедэкспертиза | ||
| RNAGEM | РНК Клеточные культуры млекопитающих, клетки, отсортированные FACS/LCM |
✔ | 15 мин | ✔ | |
| prepGEM Bacteria | Бактерии Грам +/- бактерии, протисты, колонии и жидкие культуры, биопленки, мазки, археи, почва, вода, фекалии |
✔ | 37 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
Ткани Ткани животных, хвосты мышей и крыс, плавники, насекомые и биопсийный материал |
✔ | 25 мин | ✔ | |
| forensicGEM Sperm |
Сперматозоиды Сперматозоиды, семенная жидкость, сухие пятна, генитальные мазки |
✔ | 20 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
Слюна Жидкая слюна, мазки буккального эпителия, сухие пятна |
✔ | 15 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
Кровь Жидкая кровь (свежая, с EDTA, гепарином, цитратом), мазки и сухие пятна |
✔ | 20 мин | ✔ | |
