Температуроуправляемая однопробирочная экстракция РНК из клеток млекопитающих, тканей, насекомых, бактерий и вирусов
Описание набора RNAGEM:
RNAGEM подходит для экстракции нуклеиновых кислот и обеспечивает простое выделение РНК из одной клетки или из популяции в объеме до 100 000 клеток. В набор входят ферменты, не содержащие РНКазы, буферы и ДНКаза I.
Методика обладает широкой специфичностью и подходит для экстракции материала из малых образцов, таких как экзосомы или отдельные клетки, без необходимости использования агрессивных химикатов или дополнительной очистки.
Типы образцов:
- Клеточные культуры млекопитающих;
- Клетки, полученные микродиссекцией лазерным захватом (LCM);
- Клетки, полученные путем клеточной сортировки с активацией флуоресценции / (FACS)-подготовленные клеточные популяции
Особенности:
- Оптимальный набор для получения РНК из клеток млекопитающих (суспензии, адгезивных клеток, хранящихся в реагенте RNAlater TM, и клеточных осадков);
- Упрощенный рабочий процесс без вмешательства пользователя позволяет получить готовые РНК, которые можно использовать в ОТ-ПЦР и ОТ-КПЦР примерно за 5 минут;
- Выделение РНК и ДНК с высокой степенью восстановления при работе с разным количеством клеток;
- Не требует дополнительной очистки при подготовке к ОТ-ПЦР и ОТ-КПЦР;
- Отсутствие ингибиторов позволяет не использовать жесткие химические реагенты для промывки в несколько этапов;
- Реагенты ОТ-ПЦР и ОТ-КПЦР могут быть добавлены непосредственно в лизат в 96-луночные планшеты;
- Каждый набор содержит RNAGEM, ДНКазу I, BLUE буфер, 10х ДНКазный буфер и 10х ТЕ буфер
Возможные комплектации наборов:
| Кол-во реакций | Артикул | Каждый набор включает: |
| 50 | RTP0050 |
|
| 100 | RTP0100 | |
| 500 | RTP0500 | |
| 1000 | RTP1000 |
Выделение РНК из биологических образцов затруднено присутствием РНКаз, которые разрушают РНК. Набор RNAGEM MicroGEM позволяет выделять молекулы как из культуры клеток, так и из единичных клеток.
Известно, что экстракция РНК представляет собой сложный процесс из-за низкой стабильности молекул РНК и большого количества РНКаз. Набор RNAGEM от MicroGEM решает эту проблему с помощью чрезвычайно быстрой экстракции нуклеиновой кислоты и контролем температуры реакции. Реагентика легко адаптируется к диапазону объемов экстракции и может масштабироваться в зависимости от количества клеток.
После экстракции проводится обработка ДНКазой (необязательно) для обогащения РНК. Эти реагенты могут быть добавлены непосредственно к образцу РНК для протокола под 96-луночные планшеты. RNAGEM оптимизирован для работы с различными типами культур, включая клетки в суспензии, адгезионные культуры, клетки, хранящиеся в RNAlater ™, осадки, а также клеточные популяции, полученные методом FACS и LCM.
Дополнительно молекулы РНК можно очистить добавлением ДНКазы (входит в комплект), в связи с чем протокол увеличивается на 10 минут. На рисунке показан рабочий процесс совместной очистки и экстракции РНК.
Реагенты набора RNAGEM совместимы с полимеразами и обратными транскриптазами. Полученные экстракты можно использовать без очистки для ПЦР, ОТ-ПЦР, qПЦР и ОТ-qПЦР. Это приводит к гораздо большей чувствительности и линейности в широком диапазоне.
Полученные графики отображают результаты добавления полученных экстрактов РНК (из клеток HeLa) в реакцию в RT-qPCR. Клетки в количестве от 10 до 50 000 были обработаны реагентикой RNAGEM. Графики включают информацию о мРНК с высоким содержанием (ACTB; ß-актин) и мРНК с низким содержанием (BRCA1; ранняя стадия рака груди). Чистые кривые с градиентами, которые сопоставимы со стандартами, демонстрируют отсутствие ингибирования, а графики, полученные 10 клеток, демонстрируют чувствительность метода.
Графики RT-qPCR для РНК, экстрагированной из серии разведений клеток HeLa от 10 до 50 000 клеток. A: мРНК с высоким числом копий (ACTB) B: мРНК с низким числом копий (BRCA1). Красный = стандарты; Синий = повторяющиеся кривые мРНК.
При использовании рекомендованного метода эффективность экстракции RNAGEM остается постоянной в диапазоне от 1 до примерно 100 000 клеток и дает оптимальный выход. Напротив, экстракция TRIzol® теряет мРНК из клеток с низким содержанием. Это означает, что нормализация образца может быть получена с помощью простой количественной ПЦР кДНК в экстракте, не обработанном ДНКазой. Различные диапазоны линейности могут быть получены путем небольших изменений базовой процедуры, как показано ниже.
БРОШЮРЫ:
| Вид образца | Характер использования | ||||
| Термостат / термоциклер | Время экстрации | Наука | Судмедэкспертиза | ||
| prepGEM Universal |
Клеточные культуры Суспензионные и адгезионные клеточные культуры, клетки, отсортированные FACS/LCM |
✔ | 15 мин | ✔ | |
| prepGEM Bacteria | Бактерии Грам +/- бактерии, протисты, колонии и жидкие культуры, биопленки, мазки, археи, почва, вода, фекалии |
✔ | 37 мин | ✔ | |
| prepGEM Universal |
Ткани Ткани животных, хвосты мышей и крыс, плавники, насекомые и биопсийный материал |
✔ | 25 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
✔ | 25 мин | ✔ | ||
| forensicGEM Sperm |
Сперматозоиды Сперматозоиды, семенная жидкость, сухие пятна, генитальные мазки |
✔ | 20 мин | ✔ | |
| prepGEM Universal |
Слюна Жидкая слюна, мазки буккального эпителия, сухие пятна |
✔ | 15 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
✔ | 15 мин | ✔ | ||
| prepGEM Universal |
Кровь Жидкая кровь (свежая, с EDTA, гепарином, цитратом), мазки и сухие пятна |
✔ | 20 мин | ✔ | |
| forensicGEM Universal |
✔ | 20 мин | ✔ | ||
